L’Observatoire de l’Environnement a été établi dans le but de suivre l’évolution de l’environnement dans le bassin du fleuve Sénégal pour fournir aux états membres et aux différents partenaires de l’OMVS les informations nécessaires pour mesurer les impacts environnementaux des barrages et des aménagements hydrauliques, en vue de mettre en œuvre des actions de correction et d’atténuation des effets négatifs sur l’environnement.
En mars 2002 l’OMVS a démarré la rédaction du Schéma Directeur d’Aménagement et gestion des eaux (SDAGE) afin d’établir un cadre permettant de prise en compte des demandes de tous secteurs concernés pour la planification, l’utilisation, et la gestion optimales et soutenables des ressources en eau du bassin, et rendre disponible l’information nécessaire pour la prise de décision. Le SDAGE vise à améliorer la coopération et le dialogue entre les intervenants, à définir les stratégies pour atteindre des pratiques de gestion durable, et à assurer la cohérence des activités de réglementation mises en œuvre par les états membres.
Avec la mise en eau des deux barrages de Diama et Manantali, les écosystèmes du Delta et de la Vallée ont subi des modifications importantes. L’OMVS a donc mis en œuvre le Programme d’Atténuation et de Suivi des Impacts sur l’Environnement (PASIE) dans le but de maîtriser, atténuer et corriger les impacts sur l’environnement dans une stratégie globale de protection et préservation. Le PASIE est articulé sur plusieurs composantes, s’adressant aux différents impacts et aux différents aspects environnementaux, tels que construction et exploitation des barrages, l’optimisation de la crue, les aspects liés à la santé publique, le suivi des écosystèmes à travers l’établissement d’un Observatoire de l’Environnement et le développement d’un Plan d’Action environnemental.